近年来，舆论持续关注养鸡场鸡粪处理和农田鸡（原）粪处理问题，反映出鸡粪处理的棘手问题。如何妥善处理和回收鸡禽是养殖户和主管部门须面对的问题并提出解决方案。
     在蛋鸡粪便的实际处理方面，蛋鸡产业面临的主要问题是：
（1）传统开放式鸡舍，鸡粪主要靠人工清理，劳动强度较大，频率较低；
（2）鸡粪 水分含量高，集中堆放后臭味浓，苍蝇滋生；
（3）畜牧场内处理空间普遍不足，现场处理水平低，进而导致露天曝晒、蚊蝇孳生、臭味问题；
（4）畜牧舍增（改）建不易，资金投入门槛高，影响行业收入。如果该行业打算投资加工设备，往往会面临土地容量不足和监管限制。
     鸡粪处理后，除农户自用外，另一种可行的处理方式是外包收集，即委托清运或回用经营者（如禽畜粪便处理、堆肥场）进行清理、运输并收集鸡粪，但总体比例不高。
     以上原因都是造成传统饲养场、畜舍、鸡粪处理设施升级改造缓慢的主要原因，导致当前养鸡户鸡粪处理水平难以提高。